Les méthodes Agiles impliquent la maîtrise d'ouvrage, ou MOA, d'une manière différente des projets classiques, tout en l'intégrant beaucoup mieux dans le déroulement du projet.

Formellement, il n'y a plus l'obligation d'élaborer en amont les spécifications complètes détaillées, phase très délicate où chaque faiblesse dans l'exhaustivité ou la cohérence des spécifications peut être lourde de conséquences sur le produit final (qualité fonctionnelle, coût, délai de réalisation).

Dans un contexte Agile, la MOA fait un inventaire préalable des fonctionnalités attendues, mais avec une approche beaucoup moins détaillée, puis elle continue à s'impliquer tout au long du projet par l'intermédiaire d'un représentant permanent : le product owner (directeur de produit).

Le rôle du product owner pendant le projet est de compléter, détailler et affiner l'inventaire des fonctionnalités, ou backlog produit, et d'en redéfinir les priorités. Par ses arbitrages, il oriente le projet pour maximiser le ROI (retour sur investissement) du produit développé. Il valide également à chaque fin d'itération du cycle du développement les éléments du backlog produit qu'il considère comme complètement réalisés. Il complète et détaille les éléments du backlog produit au fur et à mesure du déroulement du projet, en préparation des prochains éléments prioritaires à réaliser.